许多品种在采收完第一茬菇后菌袋内的含水量就低了，当基质中的含水量低于40％以下，菌丝的生理活动处于停止状态，基质内的营养难以转化，原基难以形成，因此需要往基 质内补充水分使之陆续长菇。需要补水出菇的品种有平菇、金针菇、香菇、茶树菇等品种。
常用的补水方法有：
①泡袋法：用大桶或水池，将菌袋放在其中，用木板加石头压上后往里加水，当水浸过菌袋，保持12～20小时，经泡水后的菌袋吸水量达到原来菌袋重量即可。
②用补水器补水：补水器是一个直径不到1厘米的，前端由一个中空状的尖头组成，壁上布有许多小孔的铁管，后端连着塑料管并连接上小型加压水泵，将小铁管插入菌袋内，然后打开开关，水注向料内。
③泡袋：对于站立式出菇的菌包，需补水时可将水灌入菌袋，以水漫过培养基量为宜，菌袋经20小时浸泡后，将菌袋内多余的水倒出，并将菌袋排好后进行出菇管理。
