茯苓采收期的确定，发现窖顶土龟裂，说明地下茯苓正在生长，用土将裂缝填好，经过一段时间不再裂缝，说明地下茯苓已成熟即可挖窖采收；不同栽培方法茯苓采收期不同，应随熟随采。
采收后先将鲜茯苓除去砂土，置于铺好稻草上，大个的铺放2层，小个的铺放3层。稻草与茯苓相间逐层铺放，最上层铺盖稻草，四周也用稻草封严，使其发汗。
第一个星期每天取出茯苓擦其表皮水珠，再堆置发汗；
第二个星期每2－3天翻动一次。当茯苓表皮长出白色绒毛状菌丝时，取出擦干净，表皮呈皱缩黑褐色，置凉爽干燥处阴干，即为成品“个苓”；用刀剥下的黑色外皮称“茯苓皮”。
将茯苓切成块片，皮下赤红色的部分称“赤茯苓”；菌核内部由色、细致、坚实的部分称“白茯苓”；白茯苓中心有一木心称“茯神木”。
不同规格的商品分别加工晒干。每窖的产量约10公斤左右。
