食用菌对pH的要求，除草菇喜碱性外，大多喜偏酸或中性的环境。而大多数病原菌喜中性或偏碱性的环境。
一、在制作菌种时，可添加适量的过磷酸钙，将培养基调酸一点，既可抑制病菌的发生，又可为食用菌提供一定的磷素。
二、在菇床上如发现一些喜碱条件的病菌，如白色石膏霉、褐色石膏霉，可将过磷酸直接撒在发病料面上。
三、草菇播种后，培养料有由碱变酸的趋势，根据草菇喜欢碱性环境的特性，可结合喷水和在每潮菇采收之后，用pH9的石灰水喷洒，以满足草菇生长对pH的需要，同时又可抑制与草菇争夺养分。
四、鬼伞类发生。因为鬼伞类喜欢酸性环境，在中性或微碱性环境则生长不良。一些在中性或微碱性环境液也能生长良好的菇类如蘑菇、平菇，栽培时所用的原料（稻草、棉籽壳等）可用1~2%石灰水调配，采菇后也可用石灰水（上清液）喷洒。
